这时，库斯诺吉馆长发现了洋辅，洋辅称两人是小偷让馆长去找君莎小姐，小胜很快反驳了洋辅并解释说他只是想参观博物馆，于是误会解除，库斯诺吉馆长邀请小智和小胜进入博物馆参观。海豹球是库斯诺吉馆长送给洋辅的宝可梦，每当洋辅让海豹球使用招式时，海豹球总是会先攻击洋辅而不是目标（和小次郎的刺球仙人掌很像）。在博物馆里，洋辅说他将来想收服角金鱼并让它进化成暴鲤龙，小胜随即纠正并告诉他只有鲤鱼王才能进化成暴鲤龙；洋辅还说他的梦想是和库斯诺吉馆长一起去世界各地的海洋旅行，然后成为伟大的科学家。
在博物馆，小智等人看到了罕见的烧焦的神秘岩石，这也是库斯诺吉馆长近期休馆的原因。经过初步的研究，发现这颗岩石可能是来自于海底，为何而形成则可能是因为高温而导致，甚至怀疑是古代的宝可梦的力量导致的东西（指向固拉多），而为此自然是引来了熔岩队的觊觎了；在火箭队三人组利用冰沙用笼子关住小智等三个小朋友的同时，熔岩队也出现袭击了库斯诺吉馆长并夺走了岩石，之后和火箭队打斗并打跑了三人组。
洋辅这边再次派出海豹球想让它破坏笼子，但海豹球依旧不听洋辅的指挥，于是小智就让龙虾小兵破坏了笼子。之后，三人与库斯诺吉馆长同熔岩队展开对峙时，库斯诺吉馆长让洋辅和小胜前往市区寻找君莎小姐；洋辅带着小胜来到海边，他们在被熔岩队的大狼犬的攻击打中前跳入了海中，而海豹球带着两人游到了附近去往市区的路，也遇到了扫荡回来找大家的明龖和小遥。但当他们带着君莎小姐来到博物馆时，熔岩队已经离开了。而熔岩队在和小智以及库斯诺吉馆长的对峙中不小心使得烧焦的神秘岩石分裂了两部分，熔岩队夺走了大的那块，而皮卡丘只抢下了小的碎片，好在库斯诺吉馆长也表示小的那块也还是能做研究的。
熔岩队主要活动地点就是丰缘地区，目的是扩大陆地的面积，增加人类的活动领域；熔岩队相信人类的发展与世界整体的幸福紧密联系，认为人类和宝可梦的共存会阻碍他们的发展。赤焰松是熔岩队的老大，他的野心就是借助传说的宝可梦固拉多的力量，令海水干涸并扩大陆地，增加陆上生物能活动的空间；赤焰松虽拥有冷静沉著的性格，但也有著对于阻碍自己的东西毫不留情的冷酷一面。火村，就是最近老是出现的熔岩队干部，他平时一副稳重的表情，但锐利的眼神让人感觉自视很高；熔岩队偷取烧焦的岩石，并称呼为“研究G的样本”，他们的几次出场其实都是为了找到能够唤醒固拉多的宝石，宝可梦世界还是异常喜欢各种石头的。
明龖在凯那市差不多呆了快二十天，开始他妈妈也是没有出现，实在不清楚又在搞什么东西，其实母亲大人的生活还真和明龖关系“不大”，也是习惯成自然；明龖一行人也是即将离开凯那市前往紫堇市，明龖也就给母亲留了讯息，其他的他也管不了，好好的把所有有用没用的装备给换了一个遍，耿鬼的承受能力也因为不断的锻炼已经有了不小的提高。小遥也是很高兴，可以在大城市好好休整了一下，虽然输了华丽大赛，但毕竟这是第一次参加；而在凯那市的大商场很好的让她过了过购物瘾，买不买是其次，反正就是喜欢这种感觉。
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